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福建兄妹 百度、阿里云免费怒放算法算力资源,加速新式肺炎新药和疫苗研发
发布日期:2024-10-13 17:42 点击次数:118
2020年的春节掩盖在新式冠状病毒肺炎疫情的阴雨下福建兄妹,牵动着每个东说念主的心。收尾1月30日上昼10点,国度卫健委收到31个省(区、市)累计请问确诊病例7736例,疑似病例12167例,累计圆寂病例170例,累计赈济出院126例。
濒临这一疫情场所,互联网企业纷繁伸出接济。百度、阿里、字节跳跃、好意思团、滴滴、搜狐等多家企业通过捐钱、捐物、推出免费退改签及斟酌信息就业等多种时势,支援一线防疫东说念主员起义疫情。不仅如斯,百度和阿里云纷繁免费怒放各自的算法算力资源,以加速本次新式肺炎新药和疫苗研发。
百度征询院免费怒放线性时刻算法,及RNA结构展望网站
1月30日,百度征询院晓喻:
将向各基因检测机构、防疫中心及全寰球科学征询中心免费怒放线性时刻算法LinearFold以及寰球上现存最快的RNA结构展望网站,以进步新式冠状病毒RNA空间结构展望速率,从而助力疫情防控。
据百度征询院科学家暴露,LinearFold算法可将这次新式冠状病毒的全基因组二级结构展望从55分钟裁减至27秒,提速120倍,爽脆了两个数目级的恭候时刻。
相较于经典算法,当前只需不到半分钟就不错拿到病毒的结构资料,进步基因检测、疫苗研发等科研中心的责任罢了,让病毒的征询及疫苗树立速率快速进步。
在线解析视频网站这次引起武汉肺炎的新式冠状病毒(2019-nCoV)与“非典”病毒、艾滋病毒、埃博拉病毒、流感病毒雷同,齐属于RNA病毒,其单链结构导致病毒更容易变异、不易树立疫苗。与2003年的“非典”病毒比较,新式冠状病毒同期具有暗藏期长的特色,而况其暗藏期仍具有较高传染性,防控责任成为与“时刻”竞走的竞速赛。
RNA 序列有丰富的空间结构,而这些结构能决定 RNA 的功能,进而匡助设想分子药物和分子检测仪。传统上,RNA二级结构展望需要三次方时刻复杂度的算法,也等于说,若是序列长度翻一倍的话,就要付出 8 倍的贪图时刻,这关于 RNA 病毒基因组这么的超长序列(举例艾滋病毒有约1万个碱基,埃博拉病毒有约2万个碱基)需要很长的恭候时刻。而冠状病毒(包括非典病毒和这次的新冠病毒)的基因组又是悉数 RNA 病毒里最长的,长达 3 万个碱基,最快的经典算法也需要 55 分钟。但愿LinearFold算法大约对科学家深远了解武汉肺炎基因组的性质以及设想针对性药物提供了灵验信息。
与此同期,百度怒放LinearFold网站给全寰球科学家免费使用,据称,该网站在RNA结构展望速率和序列长度方面,齐具有上风,在展望速率上至高无上,而且能处置的最长序列长度达10万碱基,能清闲对RNA病毒全基因组结构展望的条目。
如有需RNA结构展望算法和手艺支执的科研单元、防疫部门等,可斟酌:
百度征询院状貌专用邮箱:福建兄妹
RNA@baidu.com
阿里云向全球内行科研机构,免费怒放一切AI算力
1月29日,阿里云发达晓喻:
疫情时期,为了匡助加速新药和疫苗研发,向全球内行科研机构,免费怒放一切AI算力!
当前,中国疾控中心已顺利区别病毒,疫苗研发和药物筛选仍在分秒必争地进行。新药和疫苗研发时期,需要进行大齐的数据分析、大范围文件筛选和科学超算责任。阿里云不错提供深广的AI算力,支执病毒基因测序、新药研发、卵白筛选等责任,匡助科研机构裁减研发周期。
此前,阿里云就曾与基因公司蚁合冲破寰球记载:仅用15分钟,即可完成高精度的个东说念主全基因组测序。而在以前,科学界普遍需要120个小时智商完成近似过程。
全球健康药物研发中心GHDDI
全球健康药物研发中心GHDDI正与阿里云配合树立东说念主工智能药物研发和大数据平台,针对SARS/MERS等冠状病毒的历史药物研发进行数据挖掘与集成,怒放斟酌临床前和临床数据资源,贪图靶点和药物分子性质,并跟进新式冠状病毒最新科研动态,及时向科学界和公众公布,为新式冠状病毒科学征询提供病笃数据支执。
GHDDI针对这次新式冠状病毒卵白质序列完毕部分靶点的同源建模责任
同期,阿里云将与配合机构向全球科学共同体免费怒放斟酌药物研发资源,共同加速针对新式冠状病毒的药物研发。马云公益基金会也捐赠一亿元东说念主民币,用于支执加速推动新式冠状病毒的疫苗研发。
阿里云称,疫情时期,任何针对本次新式冠状病毒分析、疫苗新药研发的内行科研机构、学校、病院,齐不错通过邮件斟酌阿里云疫情公益小组。阿里云团队将在第一时刻与斟酌机构获取斟酌。
斟酌邮箱:
wanqing.hwq@alibaba-inc.com
免费支执的征询范围包括但不仅限于:
1 用分子能源学HPC垄断算病毒、卵白质、药物结构,靶点作用模拟和设想药物筛选的践诺,以及使用QD量子能源学等作念药物征询——免费提供阿里云高性能贪图、SCC超等贪图集群和CPU集群;
2 对病毒植株和染病者的染病DNA索求,进行基因组贪图、基因组学贪图——免费提供阿里云超算支执;
3 科研机构对全球大范围文件分析和筛选——免费提供阿里云通用平台支执;
4 在MD,MM,QD基础上作念臆造筛选——免费提供阿里云AI平台和云超算支执。
共抗疫情,咱们能赢!
福建兄妹
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